Биотехнология. Том 17 - Янулайтис А.А.
Скачать (прямая ссылка):
Последовательности нуклеотидов, служащие субстратом для рестриктаз, отличаются большим разнообразием в отношении первичной структуры. В то же время для них характерны некоторые общие черты. Согласно классификации, предложенной в 1982 г. Модричом и Робертсом [264], эти последовательности были разделены на 21 отличающийся по построению тип. За время, прошедшее после указанной публикации, было выявлено и охарактеризовано много новых прототипов. Это нашло отра-
3—5933
33
Последовательности нуклеотидов, узнаваемые рестриктазами II типа
Прототипы
№ Тип j < » 0.0. « о ? CJ S
п/п построения ш л s та «а ?-.а. о. Й 3
a-о а к а , = а §1
о ® « ю «ял _ о я«
5 ю о и g Й S S s в ы °
м 3 2 !§§? s g
ч « и о ч|о е- Л «о S СО S Ч Д а>
о сг « ь s2? (j ч в н «3 ** О Я S
* Н S «о гг Ж «о с н я ь я t- ЕГ У П
Г. Последовательности с элементами симметрии 1а. Палиндромные последовательности
1. XYY'X' 16 13 --- прототипы
перечислены
в таблице 9
2. XYZZ'Y'X' 64 51 --- »
3. XYZQQ'Z'Y'X' 256 1 GCGGCCGC Not I
16. Разорванные последовательности
4. XY (А/Т) Y'X' 16 3 GG(A/r)CC Ava II 45
GC (A/T) GC Bbv I 2
CC(A/r)GG EcoR II 59
5. XY'(C/G)Y'X' 16 3 CC(C/G)GG Cau II 19
GA(C/G)TC Pie I 2
GT(C/G)AC Tsp45 I 1
6. XYZ (А/Т) Z'Y'X' 64 1 CGG(A/T) Rsr II 2
CCG
7. XYGGY'X' 16 1 CTGGAG Gsu I 4
8. XYGAY'X' 16 1 CTGAAG Fsf I 4-
9. XYNY'X' 16 6 GGNCC Asu I 32
CTNAG Dde I 1
GCNGC Fnu4H I 4
GANTC Hinf I 12
GTNAC Mae III 1
CCNGG SorF I 12
10. XY(N)2Y'X' 16 2 GG(N)2CC Nla IV 5
CC(N)2GG Sec I 1
11. XYZNZ'Y'X' 64 3 GGTNACC BstE II 14
GCTNAGC Esp I 2
CCTNAGG Sau I 13
12. XYZ(N)3Z'Y'X' 64 3 CAG(N)3- AlwN I 1
CTG Dra III 1
CAC (N) 3- Tthlll 17
GTG
GAC(N)3-
GTC1
13. XYZ(N)4Z'Y'X' 64 1 GAA(N)4- Xmn I 2
14. XYZ(N)5Z'Y'X' 64 3 Bgl I 2
EcoN I 2
Продолжение таблицы 8
Прототипы
№ Т ип число теоре число обнару последова название про число извест
п/п построения тически воз женных вари тельность уз тотипов ных изошизо-
можных вари антов наваемая про меров
антов тотипами
15. XYZ(N)eZ'Y'X' 64 3 CCA(N)5- PflM I i
TGG BstX I 3
16. XYZ(N)9Z'Y'X. 64 1 Drd I I
HgiE II 1
Xcm I 1
17. XYZQ(N)5Q'Z'Y'X' 256 1 TGG Sfi I 1
GGCC(N)5-
GGCC
1в. Вырожденные последовательности
18. PuXX'Py 4 1 PuGCPy CviJ I 6
19. XYPuPyY'X' 16 3 ACPuPyGT Afl III 1
CCPuPyGG Dsa I 1
CTPuPyAG Sfe I 1
20. XYPyPuY'X' 16 2 GGPyPuCC HgiC I 20
GTPyPuAC Hind II 7
21. XPuYY'PyX' 16 2 GPuCGPyC Асу I 12
