Биотехнология. Том 17 - Янулайтис А.А.
Скачать (прямая ссылка):
P. vulgaris 5 1 20 [144]
Flavobacterium 6 1 16 Г3601
Haemophilus 39 13 33 [33]
В том числе:
H. influenzae 39 13 33 [33]
10. Грамотрицатель Neisseria 7 4 57 ПИ]
ные кокки и кок- В том числе:
кобациллы N. gonorrhea 7 4 57 [111]
14. Грамположитель- Micrococcus 11 2 18 Г4011
ные кокки Streptococcus 15 4 26 Г342]
15. Палочки и кокки, Bacilus 7 1 14 [360]
образующие эн Bacilus 66 10 15 [4061
доспоры Bacilus 62 20 32 [342
В том числе:
В. subtilis 34 10 29 [3421
В. cereus 5 4 80 Г3421
В. megaterium 7 2 28 [342
В. pumilus 7 1 14 [342]
Продолжение табл. 4
№ части и ее название Род (вид)* Про Обнаружено Литература
согласно определителю вере продуцентов
Берги но всего %
штам
мов
16. Грамположитель- Lactobacillus 6 _ [360П
ные аспорогенные
палочковидные
бактерии
17. Актиномицеты и Brevibacterium 6 1 16 [360F
родственные мик Bifidobacterium 15 8 53 [205
роорганизмы Streptomyces 55 12 22 [344
Strep tomyces 18 1 5,5 [360
* — В тех случаях, когда одновременной проверке подвергалось более 5*тн штаммов одного вида данного рода, полученные данные приводятся отдельно.
многочисленной группе более глубоко изученных родов микроорганизмов (величина выборки >Д0) этот показатель находится в интервале 4% (Cytophaga) — 53% (Bifidobacterium)'. Этот же показатель, если его рассматривать по отношению к таксонам в ранге вида в малочисленных иследованных группах штаммов, характеризуются следующими замечаниями: 11 % (М. virescens)—80% (В. cereus), а в группах, где одновременной проверке подвергалось более десяти штаммов одного вида — 23% (Е. coli)—34% (М. fulvus). Встает вопрос, в какой мере эти данные отражают истинную частоту встречаемости штаммов, содержащих эти ферменты. Этот вопрос имеет два аспекта. Один относится к репрезентативности проверенных выборок, а второй к выявляемое™ активности эндонуклеаз использованными с этой целью методами. Ответ на первый вопрос более менее очевиден — в большинстве случаев «систематического» поиска продуцентов рестриктаз (табл. 4) число проверенных штаммов не представляется репрензентитивным. Поэтому наблюдаемая доля продуцентов от общего числа проверенных культур вряд ли отражает это соотношение в генеральной для данного таксона выборке. Хорошей иллюстрацией этого предположения служат данные по исследованию стрепто-мицетов двумя независимыми группами ученых. В одном случае среди 55 проверенных штаммов было обнаружено 12 продуцентов рестриктаз [344], а в другом среди 18-ти — всего лишь 1 [360]. В связи с неодинаковым видовым составом исследованных групп штаммов и разницей в методах, использованных для их проверки, возможные причины наблюдаемого явления в данном конкретном случае остаются неясными. Однако, вышеизложенные сведения убеждают в том, что даже в случае относительно глубоко исследованных на данный момент таксонов необходимо проведение дополнительных экспериментов для более менее достоверного определения частоты встречаемости
продуцентов рестриктаз. Но даже в случае реализации таки? экспериментов останется вопрос о том, в какой мере установленная доля продуцентов рестриктаз отражает истинную частоту встречаемости штаммов, несущих эти ферменты.
Методы, используемые для проверки исследуемых культур (см. разд. 2, часть II), не дают полной гарантии выявления специфических эндонуклеаз во всех штаммах, содержащих их. Одной из очевидных причин этому явлению в случае применения биохимического метода может быть маскирование рестриктазной активности неспецифическими нуклеазами. Именно неблагоприятное соотношение этих ферментов по мнению Майера и Райхенбаха [249] послужило причиной того, что среди 45 проверенных штаммов Cytophaga только в двух случаях удалось выявить специфическое фрагментирование субстратов, проинкубированных с бесклеточными экстрактами исследуемых культур. Таким образом, применение традиционного метода тестирования наличия рестриктаз в исследуемых культурах дало в обсуждаемом случае исключительно низкую частоту встречаемости продуцентов. Для того, чтобы выяснить, насколько полученные данные отражают истину, необходимо применить другие методические подходы.
