Биотехнология. Том 17 - Янулайтис А.А.
Скачать (прямая ссылка):
2. Число обнаруженных рестриктаз 219
3. Число рестриктаз, охарактеризованных в отноше 123
4. нии субстратной специфичности
Число рестриктаз, различающихся по субстратной 28
специфичности
При планировании рассматриваемых экспериментов предполагалось, что если таксоноспецифичность рестриктаз существует, то с определенного момента должна «истощиться» вариабельность участков, узнаваемых этими ферментами, обнаруживаемыми в изучаемом виде микроорганизмов. Если же такая закономерность является нехарактерной, то следовал бы вывод об ее отсутствии.
Из данных, представленных в обсуждаемой публикации [189], следует, что с определенного момента наблюдается отклонение от практически линейной зависимости между числом охарактеризованных Eco (Е. coli) рестриктаз и появлением среди них новых по специфичности ферментов. Затем последние появляются все реже и начиная с 70-той охарактеризованной рестриктазы среди оставшихся 50-ти не удалось выявить ни одного нового по специфичности Есо фермента. Эти данные, конечно, не следовало бы интерпретировать таким образом, что новые Есо прототипы не будут обнаружены, но вероятность их выявления, а тем более в значительном количестве, является низкой.
Проведенные на примере штаммов Е. coli эксперименты дали подтверждение предположению о наличии таксоноспецифичности рестриктаз в том виде, как этот вопрос был сформу-
лирован — ограничение вариабельности специфичностей рестриктаз в штаммах одного вида. Следовательно можно говорить о том, что в каждом таксоне реализуется только часть возможных для царства прокариотических микроорганизмов специфичностей рестриктаз. Предлагается это явление назвать таксоноспецифичностью ферментов рестрикции [189].
Рестриктазам в клетках сопутствуют ДНК модифицирующие метилазы. Оба фермента узнают идентичные нуклеотидные последовательности. Таким образом таксоноспецифичность характерна не только для рестриктаз, но и для метилаз, являющихся составным компонентом любой системы рестрикции-модификации.
Углубленное рассмотрение литературных данных позволило выявить конкретную форму проявления таксоноспецифичности рестриктаз [189] — на этот раз не только в Е. coli, но и в семействе Enterobactereaceae, к которому этот вид относится в целом (табл. 6). Имеется в виду тот факт, что среди 144 изу-
Таблица 6
Распределение рестриктаз, узнающих последовательности нуклеотидов различной длины, в некоторых родах микроорганизмов
Число рестриктаз, узнающих последовательность нуклеотидов определенной длины
Род Oi 0) 0) О -RSl* И &
«>* ^ s и 3 i s
a|-I =1 ? О,
w S M go _
i- н ?
f- Or X О г---> S8C 4 5c a or *5 Я Э Г, f- ©“ s
tu «r* С C 5^ О Я So f OSS
H ^ в *?>> tm vO О =r>> 4 o 2 s s a
Acetobacter _ 1 11 1 13 _ 13191
Achromobacter 2 2 7 1 12 16,6% (319]
Anabaena 2 5 27 1 35 5,7 [319]
Bacillus 68 22 90 10 190 36% fl, 24, 41
11 14 52, 319]
Bifidobacterium --- 3 --- --- [47, 319]
Chlorella 9 6 --- --- 15 60% [319]
Escherichia --- 29 106 9 144 --- Г189, 319
Enterobacteria- 1 81 190 13 285 0,35% [24, 44, 4*
ceae** 42 319]
Haemophilus 16 7 19 --- 38,1% Г319]
Herpetosiphon --- 6 9 1 16 --- [319]
Micrococcus 3 2 8 --- 13 23% Г319]
Moraxella 11 3 2 --- 16 63,8% Г319]
Neisseria 20 9 17 --- 46 43% Г319]
Nocardia 1 --- 21 2 24 4,2% Г319]
Nostoc --- 8 20 1 29 --- Г3191
Pseudomonas 4 2 17 3 26 15,4% [48, 319]
Streptomyces 2 2 37 2 43 4,7% [319]
Thermus 6 3 2 4 15 40% [319]
Xanth'omonas --- --- 17 2 19 --- [319]
* — УПН-узнаваемая последовательность нуклеотидов.
** — В группу «Enterobacteriaceae* включены рестриктазы, обнаруженные в штаммах родов Escherichia (coli), Erwinia, Citrobacter, Klebsiella, Salmonella, Shigella, Enterobacter, Serratia, Proteus, Providencia.
