Молекулярная биология. Структура и функция белков - Степанов В.М.
ISBN 5-06-002573-Х
Скачать (прямая ссылка):
В -то же время нельзя не заметить, что многообразие функциональных групп белковых аминокислот не столь уж велико. Однако их химические возможности резко обогащаются в рамках специфической белковой структуры за счет образования пространственно организованных ансамблей. И все же для многих задач функциональных групп белка недостаточно, для их решения привлекаются специфически связываемые им лиганды — ионы металла, хромофорные группы, ко ферменты и т.п.
1.1. КИСЛОТНО-ОСНОВНЫЕ СВОЙСТВА АМИНОКИСЛОТ
у *
Кислотно-основные свойства аминокислот определяет одновременное присутствие в их структуре аминной и карбоксильной групп, котси рые, будучи предельно сближены, глубоко влияют друг на друга.
• В нейтральной среде, в'довольно широком диапазоне pH, о-амино-кислоты существуют как биполярные ионы, поэтому обычная запись формулы аминокислот, например глицина — М2~СН2"~С00Н, условна. Правильнее было бы писать для нейтральных растворов NH*—СНг—СОО".
Именно в такой форме биполярных иоНов — цвиттер-ионов (устаревшее название "бетаиноподобная структура") — аминокислоты существуют в нейтральных растворах и кристаллах. Влияние положительно заряженной аммонийной группы в о-положении делает а-карбоксилъ-Hffw группу значительно более сильной по сравнению с карбоксилом алифатических кислот. Так, если рКа уксусной кислоты (pH, при котором диссоциация проходит наполовину) составляет 4,7, то у глицина рКа карбоксила равен 2,34. Примерно такие же величины рКа свойственны карбоксильным группам других о-аминокислот (табл. 1.1).
8
Таблица 1.1. Амииокислоты, включающиеся в белки при трансляции (белковые аминокислоты)
.........: : ........... pK* Pi
<ьС00Н ami боко
1 » ' 1 * вой
цепи
-CH3 t 2 M 9j69 . --- 6,01
1 ; i v ,
* * * NH 2,17 * 12,84 10,76
-ССН2)зМ- 1 9,04
c-hh2
“СЙ2---co-nh2 2,02 8,60 --- 5,41
-CH2-€00H 1,88 9,60 3,65 2,77
¦ i ‘
-ch2-sh > 1,71 8,18 10,28 5,02
2,16 9,67 4,32 3,24
CH2CH2"-C0 NH2 # 2,17 9,13 --- 5,65
-1! 2,34 9,60 --- 5,97
% i
1,82 9,17 6,00 7,59
V- г и
II II
"V
СИ» 2,36 9,68 г «• Л 1 * г
1 6,02
-Cn-CHj-Oa ’
Ms 2,36 9,60 V ** Д т 5,98
JHg
~(CH2)^~WH2 2,18 9,12 10,53 9,82
CH2CH2-S-CH3 2,2$ 9,21 --- 5,74
-СН2-СбН5 11*83 9,13 5,48
Название
Сокра-
щенное
обозна-
чение
Аланин
' Iе ! 1
1
Аргинин
Аспарагин
Аспарагиновая
кислота
Цистеин 1
Z' ¦
Глутаминовая
Ш
кислота
Глутамин
Глицин
Гистидин
Иэолейцин
Лейцин
- >
Лизин
Метионин
Ala, А
Arg, R Asn, N Аяр, D
Сув, С Glu, Е
Gln,Q Gly, G His, Н
He, I
Leu, L
Ibys, К Met, M
Фенилаланин jphe, F
9
Продолжение Нтбл. 1.1
Название Сокра Структура R ' рКа Pi
q-COOH . ж X боко
вой
цепи
Пролин - Pro, Р сн2~---СН2 * 1,99 10,6 / *. ;6,30
' » 1 \ 1
1, СИ 2 си-соон
V"
н
Серии Ser, S -<Я2-€Н 2,21 9,15 5,68
Треонин Thr.T Z13 2,71 9,62 6,16
-ClT
Триптофан 1 vlll - 2,38 9,39 5 5,89
. 1 . -св2---с-
II II 1
W
я
Тирозин Туг, Y 2,20 9,11 10,07 5,66
1 Уа1, V vn vlr 2,32 9,62 - 5,96
Валин ^СНз
-ci(
NjHa
‘Структура пролина приведена полностью.
