Вирусология: В 3-х т. Том 1 - Филдс Б.Н.
ISBN 5-03-000283-9
Скачать (прямая ссылка):
166. Weiss R. A., Mason W. S., Vogt P. K. (1973). Genetic recombinants and heterozygotes derived from endogenous and exogenous avian RNA tumor viruses, Virology, 52. 535—552.
167. Weiss R., Teich N.. Varmus H„ Coffin J., eds. (1982). RNA Tumor Viruses, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY.
168. Wilson J. H., DePamphilis М., Berg P. (1976). Simian virus 40 permissive cell interactions: Selection and characterization of spontaneously arising monkey cells that are resistant to simian virus 40 infection, J. Virol., 20, 391—399.
169. Wolgemuth D. J., Hsu М. T. (1980). Visualization of genetic recombination
intermediates of human adenovirus type 2 DNA from infected HeLa cells, Nature (Lond.), 287, 168—170.
170. Yamamoto T„ Shimojo H. (1971). Multiplicity reactivation of human adenovirus type 12 and simian virus 40 irradiated by ultraviolet light, Virology,
45, 529—531.
171. Yoshiike K. (1968). Studies on DNA from low density particles of SV40. I, Heterogeneous defective virions produced by successive undiluted passage, Virology, 34, 391—401.
172. Young C. S. H., Silverstein S. J. (1980). The kinetics of adenovirus recombination in homotypic and heterotypic genetic crosses, Virology, 101, 503—515.
173. Youngner J. S., Preble О. T. (1980). Viral persistence: Evolution of viral populations. In: Comprehensive Virology, Vol. 16, ed. by H. Fraenkei-Conrat and R. R. Wagner, pp. 73—155, Plenum Press, New York.
174. Youngner J. S., Quagliani D. O. (1978). Temperature sensitive mutants of VSV are conditionally defective particles that interfere with and are rescued by wild type virus, J. Virol., 19, 102—107.
175. Zavada J. (1972). Pseudotypes of vesicular stomatitis virus with the coat of murine leukemia and avian myeloblastosis viruses, J. Gen. Virol., 15, 183—191.
176. Zavada /., Rosenburgova M. (1972). Phenotypic mixing of vesicular stomatitis virus with fowl plague virus, Acta Virol., 16, 103—114.
Молекулярная генетика вирусов животных
Дэвид М. Найп1
Генетические взаимодействия между вирусами эукариот и между вирусами и хозяйскими клетками описаны в гл. 7. По мере того как повышался уровень изучения генетики многих вирусов, в большей части работ стали 'проводить глубокий анализ геномов с использованием специальных воздействий на геномы, во многих случаях при помощи мутагенеза in vitro и перестройки структуры ДНК. Эта возможность появилась благодаря успехам, достигнутым в технологии рекомбинантных ДНК, которые сыграли большую роль в генетических исследованиях как ДНК-содержащих, так и РНК-содержащих вирусов. Недавнее сообщение о системе рекомбинантной РНК для амплификации молекул РНК [80] может направить генетику и тех, и других вирусов в еще одном перспективном направлении.
В настоящей главе рассматривается, как эти новые методы могут быть или уже были применены для изучения вирусных геномов. Поскольку конечная цель наших исследований заключается в понимании генетики и биологии вирусов, а также механизма их взаимодействия с клетками хозяев, мы будем опираться на некоторые работы, освещающие основы биологии вирусов.
Клонирование рекомбинантных структур вирусных ДНК
Возможность размножать и нарабатывать вирусные геномы в виде молекул рекомбинантных ДНК предоставляет специалистам псГ молекулярной биологии вирусов следующие преимущества. а) ДНК-геномы вирусов, которые трудно или невозможно выращивать в культуре (таких как вирус гепатита В или вирус папилломы), могут быть получены в больших количествах в виде
1 David М. Knipe, Department of Microbiology and Molecular Genetics, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts 02115.
рекомбинантных молекул, б) Субгеном-ные фрагменты ДНК, которые трудно выделить из суммарного генома, расщепленного рестрикционными эндонуклеазами, могут быть получены -в гарантированно чистом виде путем клонирования, в) Молекулы редких вирусных ДНК, такие как провирусы ретровирусов, могут быть получены в больших количествах, г) Могут быть получены и клонированы ДНК-копии геномов РНК-содержащих вирусов. д) Все эти молекулы служат отличными объектами для быстрого ееквенирования и мутагенеза in vitro.
Процедуры, применяемые для молекулярного клонирования ДНК, подробно описаны в работе [70]. Небольшие кольцевые геномные молекулы ДНК можно клонировать путем расщепления рестрикционной эндонуклеазой, делающей один разрыв во всей молекуле, и лигирования с обработанной сходным образом молекулой плазмидной ДНК [92, 96]. Рекомбинантные молекулы ДНК вводят IB Escherichia coli при помощи стандартной процедуры [70]. Линейные двухцепочечные молекулы вирусной ДНК клонируют в виде субгеномных фрагментов ДНК. Расщепление линейной геномной молекулы ДНК при помощи большинства рестрикционных эндонуклеаз дает как внутренние, так и концевые фрагменты. Внутренние фрагменты могут быть клонированы путем прямого лигирования € расщепленной плазмидной или фаговой ДНК, как описано выше. Концевые фрагменты не содержат сайта для клонирования на одном конце. Для того чтобы обойти эту трудность, к концу молекулы вирусной ДНК пришивают синтетический фрагмент, содержащий участок расщепления рестрикционной эндонуклеазой (линкерную молекулу) [83], или до клонирования на одном конце достраивают гомополимер-ную последовательность ДНК при помощи концевой трансфе-разы [128].
