Проблема белка. Том 3: структурная организация белка - Попов Е.М.
ISBN 5-02-001911-9
Скачать (прямая ссылка):
Олигопептиды, пространственное строение которых было изучено теоретически другими авторами, перечислены в табл. III.33. Такие исследования проводились, в основном, тремя группами исследователей: С.Г. Галактионовым и сотрудниками, Г. Шерагой и сотрудниками, Дж Де-, Коэном и сотрудниками. Большая часть изученных соединений (1-15) - это пептиды, содержащие не более десяти аминокислотных остатков. Пространственное строение ряда молекул (пептиды 2, 3, 5, 8, 9, 10) было рассчитано сотрудниками сразу двух или трех групп; строение некоторых молекул пептидов (8, 9, 10, 13, 14, 17) исследовалось одновременно в группах Галактионова и автора данной монографии. Следовательно, появилась возможность для сопоставления результатов расчета, если не с экспериментом, то хотя бы друг с другом. Сравнение данных конформационного анализа, полученных для ангиотензина II, окситоцина, вазопрес-сина, энкефалинов и а-меланотропина, уже было сделано (см. гл. 9-12).
Начнем обсуждение с одного из самых простых физиологически активных олигопептидов - тиролиберина (<Glu1-His2-Pro2NH2), конформа-Дионные возможности которого теоретически рассматривались Г. Шерагой й соавт. [268, 269], Дж. Викаром и соавт. [270], М. Гудманом и соавт. [267], а также Дж. Джорджем и JI. Клером [271] и Р. Фларри и соавт. [272]. В последних двух работах использовались квантовохимические методы (расширенный метод Хюккеля и CNDO/2). Рассчитанные значения конформационных параметров глобальных конформаций тиролиберина Сопоставлены в табл. III.34. Обращает на себя внимание практически Полное несовпадение результатов всех выполненных расчетов этого йептида. Различия, причем значительные, касаются не только численных Значений всех углов внутреннего вращения, но и их положений в низкоэнергетических областях конформационной карты ф - у, т.е. форм Основной цепи остатков. Согласно расчетным данным авторов [268-271], Центральный остаток His имеет форму В; в работе же [267] он определен В R-состоянии, которое для остатка, предшествующего Pro, является Ьысокоэнергетичным; рассчитанные в работе [272] значения углов ф, у Того же His лучше всего отвечают на карте ф - у области L. По-разному ВО всех случаях ориентированы остатки ProNH2 и <Glu', а также боковая Цепь His. Отсутствует совпадение, даже качественное, результатов, полученных Т. Ямадой и соавт. [273] и С. Г. Галактионовым и соавт. [48] в Анализе другого простого пептида - тетрагастрина (AcTrp’-Met^-Asp3-Phe4NH2), являющегося С-концевым фрагментом гастринового гормона. В
Прнродиые и синтетические пептиды, изученные методом теоретического конформационного анализа
№ п/п Природный пептид Число Синтетический аналог Литературный
амино источник
кислотных
остатков
1 Глутатион 3 [181]
2 Меланостатин 3 [265, 266]
3 Тиролиберин 3 [N- MeHis2]-тиролиберин [267-272]
4 Тафцин 4 [48]
5 Тетрагастрин 4 [48,273]
6 Проктолин 5 [274]
7 Вазоактивный пептид 5 [275]
8 Ме!-энкефалин 5 [D-Ala2]-,[Ala2]-, [D-Ala3]-,[D-Ala2, N-MePhe4]-, [D-Met2, Pro5]-, [180-182, 190,
[D-Ala, N-MeMet5]-энкефалин 196, 197, 269,
276]
9 Ьеи-энкефалин 5 [D-Arg2]-, [D-Ala2, D-Ьеи5]-энкефалнн [48, 181, 269,
276]
10 Ангиотензин II 8 [Gly1]-, [Gly2]-, [аза- Val3]-, [аза- Туг4]-, [аза- Val5]-, [22, 47-50, 274,
[аза- His6]-ангиотензин II 276, 277]
11 Ксенопсин 8 [278]
12 Брадикинин 9 [des- Arg9]-, [D - Phe6, des- Arg9] - брадикинин [48, 279]
