Физика процессов эволюции - Эбилинг В.
Скачать (прямая ссылка):
В табл. 8.5 приведены некоторые результаты численного моделирования при д = 5 и 6 = 1/5. Интересно отметить, что сложность полученных последовательностей, несмотря на очень простые правила, не уступает сложности последовательностей, образующихся в случае игры в имитацию.
В третьем варианте имитации (или в игре в имитацию типа III) правила игры смешанные: они представляют собой комбинацию правил I и II типа. Выбранное значение равно
Ef = wit
где to = 1, 2, 3,4 для начальных («заглавных») букв A,B,C,D. Правила вычисления значений последовательностей букв сводятся к следующим.
IF a§(p TO p + 1 = AB LET to : = to + 1,
IF a§(p TO p + 1 = AD LET to : = w - l/(g +
IF a§(p TO p + 1 = BA LET to : = to --- 1/3,
IF o§(p TO p + 1 = BC LET to : = to + q/3,
IF o§(p TO p + 1 = BD LET to : = to - l/(g +
IF a§(p TO p + 1 = CA LET w : = w + q/4,
IF o§(p TO p + 1 = CB LET to : = to --- 1/2,
IF o§(p TO p + 1 = CD LET to : = to + 2,
IF a§(p TO p + 1 = DA LET to : = to + 1,
IF a§(p TO p + 1 = DB LET to : = to/4,
IF a§(p TO p + 1 = DC LET to : = to + q/4,
IF <*§(?) = a§(p + g) LET to : = to + 6.
В табл. 8.6 представлены результаты нескольких вариантов численного моделирования при д — 5 н b — q = р - д [(р - 1)/д] при постоянных частотах мутации.
Имитация эволюции последовательностей с помощью численных экспериментов сопряжена с относительно большой затратой компьютерного времени, но на первых этапах численное моделирование широко использовалось для достижения понимания наиболее существенных особенностей реальной эволюции (Swetina, Schuster, 1982; Anderson, Stein, 1984; Schuster, 1987; Fontana, Schuster, 1988; Kaufmann, 1993; Редько, 1986). Наконец, для более глубокого понимания эволюционных моделей был предпринят также ряд аналитических исследований (McCaskill 1984; Demetrius, 1983; Demetrius et ai, 1985; Rumschitzky, 1986).
Таблица 8.5. Игра в имитацию с фрустрацией (тип II) для 100 последовательностей и 3 зависящих от длины частот мутаций (для максимальной длины v = 32). В каждом случае приведены 5 «наиболее ценных» последовательностей с их селекционными ценностями (в скобках) и число их представителей
< = 0 100 х ABCCDABC ba 100 x ABCCDABC (E = 7,6) 100 x ABCCDABC (E = 7,6)
il
On
< = 1 1 х CBCCDABC (8,4) i3 x DABCCDABCC (12,0) 4 x CABCCDABC (9,6)
79 х ABCCDABC (7,6) 46 x DABCCDABC 11,8) 1 x CBCCDABC (8,4)
8 х ABCDDABC (7,6) 7 x DABCCDABCB (U,8) 3 x ABCCDABCC (7,8)
2 х BBCCDABC (7,4) 4 x DABCCDABCA (U,8) 5 x ABCCDABCA (7,6)
3 x BBCCBABC (5,4) 1 x DABCCDABAC (10,8) 1 x BBCCDABC (7,4)
i = 2 19 x DBCCDABC (9,4) 1 x DCDABCCDABCCC (13,2) 4 x DABCCDABCA (11,8)
1 x CBCCDABC (8,4) 2 x CDABCCDAB CCC (12,2) 5 x CABCCDABCC (9,8)
57 x ABCCDABC (7,6) 39 x DABCCDABC (U,8) 5 x DABCDDDBCA (9,6)
11 x ABCDDABC (7,6) 1 x DABCCDABCA (11,8) 3 x CABCCDABCB (9,6)
2 x ABBCCDABC (7,4) 5 x DABCBDABC (10,8) 3 x DABCCDDBCA (9,6)
< = 3 42 x DBCCDABC (9,4) 2 x DABCCDABCAB (12,2) 1 x DABCCDABCD (12,8)
5 x BDCBCCDABC (9,4) 2 x CDABCCDABC (12,0) 17 x DABCCDABCA (11,8)
5 x DBCCDABCD (9,4) 27 x DABCCDABC (11,8) 1 x DABCCDABDA (11,6)
1 x DBCCDABCB (9,4) 16 x DDABCCDABC (4,8) 2 x DABCBDABCA (10,8)
25 x ABCCDAABC (7,6) 5 x DDABCCDABCB (11,8) 1 x DADACDABCA (10,4)
< = 4 1 x DBCCDABCD (10,4) 4 x DDABCCDAB CD (12,8) 1 x DABCCDABCCB (12,0)
1 x DBCCDABCC (9,6) 2 x DABCCDABCD (12,8) 1 x DABCCDABCC (1?,0)
58 x DBCCDABC (9,4) 43 x DABCCDABC (U,8) 37 x DABCCDABCA (11,8)
23 x BCDBCCDABC (9,4) 2 x DABCCDABCB (11,8) 3 x DABCCDABCAC (11,8)
6 x ABCDDABCD (8,8) 1 x DABCDDABC (11,8) 1 x DAB BC DAB CAD (11,8)
< = 5 11 x DBCCDABCD (10,4) 1 x CDABCCDAB CCD (13,4) 5 x DABCCDABCDC (12,8)
1 x DBCCDABCC (9,6) 2 x DABBCDABCD (12,6) 1 x DABCCDABCAB (12,8)
49 x DBCCDABC (9,4) 22 x DABCCDABC (11,8) 1 x DABBCDABCAB (12,6)
17 x BCDBCCDABC (9,6) 3 x DDABCCDABC (11,8) 1 x DABCCDABCAD (12,0)
2 x DBCDDABCC (9,4) 13 x DABCADABC (10,8) 7 x DABCCDABCA (11,8)
Глава 8. Мутации и спирали эволюции
Таблица 8.6. Игра в имитацию типа ill (100 последовательностей, 3 различные частоты мутаций MR при общей длине последовательностей v = 32)
(MR) = 0,03 (MR) - 0,1 (MR) = 0,3
i = 0 100 x ABCDABCD 100 x ABCDABCD 100 x ABCDABCD
