Научная литература
booksshare.net -> Добавить материал -> Биология -> Лазуркина Ю.С. -> "Физические методы исследования белков и нуклеиновых кислот" -> 19

Физические методы исследования белков и нуклеиновых кислот - Лазуркина Ю.С.

Лазуркина Ю.С. Физические методы исследования белков и нуклеиновых кислот — Наука, 1967. — 343 c.
Скачать (прямая ссылка): fizmetodiisledovaniyabelkov1967.djvu
Предыдущая << 1 .. 13 14 15 16 17 18 < 19 > 20 21 22 23 24 25 .. 133 >> Следующая

Рис. 17. Геометрическое представление условий дифракции иа совокупности кристаллов, ориентированных беспорядочно вокруг оси аксиальной текстуры
Рис. 18, Рентгенограмма A-формы натриевой соли ДНК
ки, с одним общим индексом. Значения индекса определяют номер слоевой линии. Нулевая слоевая линия рентгенограмм волокон иначе называется экватором; линия, перпендикулярная ей и проходящая через центр рентгенограммы, называется меридианом.
На рис. 18 изображена рентгенограмма так называемой A-формы натриевой соли ДНК. Это типичная рентгенограмма волокна. Небольшой угловой разброс кристаллитов вокруг оси, перпендикулярной оси текстуры, приводит к размытию максимумов по дугам.
Далее рассмотрим влияние несовершенства упаковки цепей на дифракционную картину волокна. Это довольно сложная и специальная задача, поэтому мы ограничимся здесь лишь перечнем тех особенностей рентгенограммы, которые вызваны отли-
чиями структуры упорядоченных областей в иолимерах от строения правильных кристаллитов. Болес подробно см. [6].
Во-первых, рассмотрим тот случай, когда трехмерная упа* ковка идентичных элементов разных цепей сохраняется, но является дефектной. Это означает, что каждый из таких элементов слегка смещен из правильного положения в элементарной ячейке и в среднем мы имеем дело со статистическим набором таких смещений. Подобные дефекты в структуре кристаллита приводят к усилению спада интенсивности отраженных лучей с ростом угла отражения. Чем больше среднее квадратичное смещение элементов из правильного положения, тем резче спад интенсивности. Кристаллиты в волокнах биополимеров всегда дефектны, поэтому их рентгенограммы состоят из небольшого числа дифракционных максимумов, расположенных в центральной части. Лаже рентгенограммы сравнительно «упорядоченной» ДНК содержат значительно меньше отражений, чем следовало бы ожидать для правильного кристалла. С уменьшением размеров кристаллитов увеличивается размытие дифракционных максимумов, они становятся более «диффузными».
Специфические дефекты в упаковке цепочек, такие, как их неупорядоченный сдвиг по длине, приводят к особым дифракционным эффектам (6, 69]. В этом случае на всех слоевых линиях, кроме нулевой, исчезают дискретные максимумы и наблюдается лишь непрерывное размытие дифрагированного излучения с образованием штрихов вдоль слоевых линий. Как правило, неупорядоченный сдвиг цепочек по длине связан одновременно с расстройкой ориентации соседних молекул вокруг оси волокна. Непрерывное размытие интенсивности вдоль слоевых линий определится в этом случае некоторым усредненным значением структурного фактора периодического элемента цепочки. Несогласованный изгиб цепочек приведет к увеличению размытия интенсивности с ростом угла отражения как вдоль слоевых линий, так и в поперечном направлении. Дополнительная аморфная набивка ячеек вызовет увеличение фона на рентгенограммах.
Обычно волокна биополимеров содержат и такие области, где сегменты цепочек не являются параллельными один другому и упаковка их неупорядочена. Наличие таких областей приводит к появлению диффузных колец.
Таким образом, па ренгтенограммах волокон биополимеров могут наблюдаться самые разнообразные дифракционные эффекты. Они отражают специфику химического строения большинства биополимеров — нерегулярность чередования различных в стереохимическом отношении боковых групп и обусловленные ею дефекты в упаковке цепных молекул.
в. Экспериментальные методы получения рентгенограмм волокон
Методы съемки рентгенограмм волокон сравнительно просты. Как правило, волокна биополимеров снимают на излучении, полученном от трубки с медным анодом. Так как дифракционное поле волокон сосредоточено в основном в области ^—-<0,3,
его можшо зафиксировать почти целиком на одном снимке. Для того чтобы получить рентгенограмму волокна типа рентгенограммы, изображенной на рис. 18, достаточно направить на пучок волокон, перпендикулярно их длине, монохроматический рентгеновский луч и поместить плоскую фотопленку за образцом.
Если степень ориентации препарата высока, то, направляя луч перпендикулярно длине волокна, мы не должны наблюдать меридиональных отражений, так как они получаются от плоскостей, перпендикулярных длине волокон. Обычно, однако, приходится иметь дело с небольшим рассеянием текстуры — около 10—15 град. При этом такие плоскости будут отклоняться от точной ориентации на угол, соответствующий рассеянию текстуры. Поэтому обычно удается на плоской пленке фиксировать меридиональные отражения с брегговскими углами до 15 град. При наблюдении меридиональных отражений, которым соответствуют большие брегговские углы, необходимо волокна ориентировать по отношению к рентгеновскому лучу так, чтобы он составлял соответствующий брегговский угол с интересующей нас плоскостью. Для фиксации дальних отражений, соответствующих малым межплоскостным расстояниям (например, 1,5 А в белках или 1,7 А в ДНК), необходимо использовать камеры с цилиндрической кассетой.
При получении рентгенограмм малоупорядоченных объектов возникают дополнительные сложности. Фон на рентгенограммах таких объектов, обусловленный аморфными областями препарата, может оказаться настолько сильным, что он забьет слабое рассеяние кристаллической фазой, на долю которой будет при* холиться лишь небольшая часть объема облучаемого образца. Интенсивность фона будет тем больше, чем более гетерогенным (по длинам волн) является используемое излучение. Особенно это относится к коротковолновым компонентам спектра. В таких случаях монохроматизация луча при помощи никелевого фильтра оказывается недостаточной и рекомендуется использовать излучение, полученное отражением первичного луча от монокристалла.
Предыдущая << 1 .. 13 14 15 16 17 18 < 19 > 20 21 22 23 24 25 .. 133 >> Следующая

Реклама

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed

Есть, чем поделиться? Отправьте
материал
нам
Авторские права © 2009 BooksShare.
Все права защищены.
Rambler's Top100

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed