Научная литература
booksshare.net -> Добавить материал -> Биология -> Дэвид Г. -> "Иммунология. Том 2" -> 45

Иммунология. Том 2 - Дэвид Г.

Дэвид Г., Томас Дж. Иммунология. Том 2 — М.: Мир, 1987. — 456 c.
ISBN 5-03-000497-1
Скачать (прямая ссылка): immunologiyat21988.djvu
Предыдущая << 1 .. 39 40 41 42 43 44 < 45 > 46 47 48 49 50 51 .. 283 >> Следующая

Таблица 14.1. Сравнение аминокислотных последовательностей молекул HLA-B7, HLA-A2 и пула антигенов класса I человека1) 114,15]
10 20 30 40 50 60 70
HLA-B7 GSHSMR YFYTSVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAASPREEPRAPWIEQEGPEYWDRNTQIYKAQ.
Н1А-А2 .........F...............А....................Z--M.................. KV---H
Гул ....................О---А......N...............Q...................Q .....н
80 90 100 110 120 130 140
HLA-B7 AQTDRESLRNLRGYYNQSEAGSHTLQSMYGCDVGPDGRLLRGHDQYAYDGKDYIALNEDLRSWTAADTAA HLA-A2 -+H-V--V-D-GT...............R.........S--W--F-VH.............К............М---
Пул .......................................................1..................-.....
150 160 170 180 190 200
HLA-B7 QITQRKWEAAREAEQRRAYLEGECVEWLRRYLENGKDKLERADPPKTHVTHHPISDHEATLRCWALGFYP
HLA-A2 — К-Н........-V-L........Т.........-’--a-NA-ET..Т.....Н —-AV.....-...........
Пул ............А........................R......................................
220 230 240 250 260 -270
HLA-B7 AEITLTWQRDGEDQTQDTELVETRPAGDRTFEKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLT HLA-A2 ..............................................Q...................
Пул ............N.....N............-Q................................
1) Расшифровка буквенных обозначений аминокислотных остатков приведена в подписи к рис. 14.3
продуктов. Большую помощь при решении этого вопроса окажут данные по изучению структуры антигенов мыши.
Структурный анализ пула антигенов класса I привел к несколько неожиданным результатам. По данным секвенирования в большинстве случаев, несмотря на гетерогенность пула, в каждом конкретном положении находится лишь по одной аминокислоте. За исключением 12 положений, аминокислотные остатки, выявляемые в максимальных количествах, были идентичны остаткам, определяемым в аналогичных положениях молекулы HLA-B7. Это наблюдение, возможно, отражает преобладание в изучаемой популяции некоторых (немногих) вариантов молекул А, В и С или, напротив, указывает на то, что вариации достаточно широко распределены по всей длине цепи, вследствие чего большинство антигенов в случайно подобранной выборке с большой вероятностью могут иметь идентичный аминокислотный остаток в любом конкретном положении. Предполагается, что если бы 10—20% молекул имели различия по одному и тому же положению в цепи, соответствующее положение было бы выявлено при секвенировании. Анализируя результаты секвенирования пула цепей, следует тем не менее учитывать некоторые технические детали. Например, для получения С-концевых участков полипептидных цепей авторы использовали метод кислотного отщепления, поэтому полипептиды, не содержавшие
6-01622
12 345 6 7 8 Я Гомология
H-2K“ GPHSLRYFVTAVSRPGLGEPRYMEVGYVDDTEFVRFDSDAENPRYEPRARWMEQEGPEYWERETQKAKGNEQSFRVDLRTLLGYYNQSKG с «Ь %
H-2L0 ....М----Е.............IS.......NK...................Р..............I--1----Q---W--N......... --А- 85
HLA-B7 .....Y-S.....Р.....F I S....Q..........AS--Е.....Р- I........D- N---I Y- AQA -TD--ES-- N-R.ЕА 68
10 11 12 13 14 15 16 17 18
Н-2К“ GSHTIQViSGCEVGSDGRLLRGYQQY A Y DGCD YIA LNEDLKT WT AADMAALITKHKWEQAGEAERLRAYLEGTCVEWLRRYLKNGNATLLRT
H-2Ld • Т--L-WMY---D..........E-F.....................F--SSQ--RR........A---YY.....Е......Н............. 79
HLA-B7 ....L-SMY---D--P.......HD.......К..........RS.....T---Q--QR--А - R--QR......Е..........E---KDK-E-A 71
19 20 21 22 23 24 25 26 27
Н-2К° DSPKAH VTHHSRPEDKVTLRCWALGFYPADITLTWQLNGEELIQDMELVETRPAGDGTFQK WAS VV VPLGKEQ Y YTCHVYHQGLPEPLTLRW
H-2L0 .........P-SKGE............................Т................................N------R..Е.......... 90
HLA-B7 -Р---Т...PIS-HEA................Е.....RD--DQT---T.........R--E---А.....S-E---R.....Q-E----К...... 73
28 29 30 31 32 33 34
Н-2К“ EPPPSTVSNMATVAVLVVLGAAIVTGAVVAFVMKMRRRNT GGKGGDYALAP GSQTSDLSLPDCK VMVHDPHSLA
H-2L3 .........D--Y---VI..G......МАИ--...........О..............-............S-EM---R.... А 78
HLA-B7 ---SSQSTVP VG V А V AV-----VV.........А----С() — К S S ...S-SQ--A С — DS A QG - D V S L Т А 37
1) Сравнение аминокислотных последовательностей антигенов класса I мыши и человека. Последовательность Н-2КЬ приведена из работы Колигэн и ДР. [2], последовательность H-2Ld составлена сочетанием данных по секвенированию белка и ДНК [34]. Последовательности расположены в соответствии с экзонами, выявленными при секвенировании ДНК. Последовательность HLA-B7 приведена из работы Орр и др. [13].
лабильную в кислой среде связь между аспарагиновой кислотой и пролином, выпадали из анализа последовательности С-концевого участка. Подобный нежелательный «отбор» полипептидных цепей может происходить при любом из используемых методов выделения.
Предыдущая << 1 .. 39 40 41 42 43 44 < 45 > 46 47 48 49 50 51 .. 283 >> Следующая

Реклама

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed

Есть, чем поделиться? Отправьте
материал
нам
Авторские права © 2009 BooksShare.
Все права защищены.
Rambler's Top100

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed