Научная литература
booksshare.net -> Добавить материал -> Биология -> Антонов В.К. -> "Химия протеолиза " -> 86

Химия протеолиза - Антонов В.К.

Антонов В.К. Химия протеолиза — М.: Наука, 1991. — 504 c.
Скачать (прямая ссылка): himiyaprotezana1991.djvu
Предыдущая << 1 .. 80 81 82 83 84 85 < 86 > 87 88 89 90 91 92 .. 278 >> Следующая

О
о
и
III
IV
о
S
V
VI
Однако тионопептида являювся ингибиторами леЙ1"Тнамиг опептидазы [ 1789 1 -
n-Нитрофенилтиоацетат гидролисуется химотриивином практически с той же скоростью, что и п-нитрофенилацетат [1787], однако для гидролиза этиловых эфиров наблюдается более высокая реакционная способность тиоэфиров по сравнению с кислородными эфичами Н790-17У31.
Из других типов связей, расщепляемых сериновыми протеазами, следует упомянуть гидразиды, гидроксаматы [17941 и широко используемые для тестирования многих протеаз га-нитроаюйЕИДЫ
4.3.1.2. Пос.щионняя специфлчго' ть
Позиционная специфичность амидгидролаз ясна из номехза их классификации и не нуждается в специальном рассмотрении за исключением тех случаев, когда фермент проявляет двойственную специфичность или когда новые данные заставляют пересмотреть принятую классификацию. Так, оказалось, что катепсин 3 проявляет не только эндопептидазную а суивность, но и функционирует как дипепти-дилкарбоксипептидаза [763,1795-17971. Другая цистеиновая протеиназа - катепсин Н функпион:!рует преимущественно как аминопептидаза, одпако гидролизует n-нитроанилид бензоиларгинина [17981. Еще один пример - действие ангиотензин превращающего фермента на защищенные олигопептиды. Гидролиз релизинг фактора лютеинизирующего гормон; 1этим ферментом происходит, как это показано на схеме [17991:
I 1 1
GluHlsIrp-Spi'Tyr-GlyLeu-ArgProOlyra,.
Отмечена способность зериновых карооксипептидаз проявлять эндопептидаз ную активность [18001. Карбоксипептидаза Y, кроме того, катализирует гидролиз изопептидных связей, образованных р-карбоксильной группой аспарагиновой кислоты в некоторых белках [1801].
4.3.1.3. Первичная специфичность
Очень большое число работ посвящено влиянию остатков, соседние с расщепляемой связью, на скорость гидролиза субстратов. Собственно первичная специфичность определяется не только положе] мем данного остатка в цепи полипептида, но и его вкладом в наблюдаемую скорость гидролиза. В некоторые случаях этот вклад имеет решающее значение. Так, трипсин и сходные с ним ферменты расщепляют связи образованные карбоксильной грушюй основных аминокислот (Lys, Arg), и этот фактср является наиболее важным для катализа, тогда как в других случаях (напримяр, у пепсина) характер остатков, примыкающих к расщепляемой связи, может иметь меньшее значение, чем характер, удаленных от нее остатков. Первичная специфичность папаиив определяется остатком в положении Р2 (см. номенклатуру: [17451) полипентидной цепи [18021. Однако, чтобы не создавать путаницу в терминологии, здесь мы будем рассматривать первичную специфичность как специфичность к остаткам в положениях Р1 и PJ пептида.
В структуре 1МИНокислотого остатка можно различать три важные для специфичности группировки: бокс зая цепь (R), заместитель при атоме азота (X) и
заместитель при карбонильной группе (Y):
X-NHCHCO-Y.
А
Структурные особенности группы R определяются ее свойствами: липофиль-ностью (гидрофобностью), объемом и зарядом. Группа X может быть атомом водорода или полипептидной цепью, а группа Y - полипептидной цепью, алкокси-или алкил(арил)аминогруппой или гидроксилом. Все эти особенности имеют решающее значение для специфичности.
Очень небольшое число протеаз обладает абсолютной специфичностью к какому-либо конкретному остатку аминокислоты. К таким ферментам относятся, например, 5-оксопролил-пептидаза (3.4.19.3), специфичная к N-концевому пиро-глутамильному остатку [704,18031, некоторые дипептидазн [1024,1028,10381, пролинспецифичные ферменты [222,10301. Однако уже эти последние гидролизуют также связи, включающие остатки оксипролина, N-метилаланина, саркозина и аланина [1804,18051-
Большинство протеаз обладает "групповой" первичной специфичностью. Можно различать ферменты, гидролизующие амидные связи, образованные: а) основными остатками аминокислот (Lys, Arg, His), б) объемистыми гидрофобными остатками (Тгр, Туг, Phe, Leu), 6) алифатическими неполярными остатками (Gly, Ala, Ser, Ил, Asn), г) остатками, содержащими карбоксильную группу в боковой цепи (Asp, Glu), и 0) остатками, содержащими третичный атом азота в основной цепи (Pro, Hyp и др.).
По-видимому, наиболее распространены протеазы первой группы - группы трипсина. В нее входят как амино-, так и карбоксипептидазы [682,1064,18061, важные пищеварительные ферменты - сам трипсин и энтеропгптидаза [18071, ферменты системы коагуляции крови [313,1808-18131, системы комплемента [558,18141, многочисленные и еще мало исследованные ферменты процессинга [1815,18161. Среди последних ряд ферментов специфичен к парам основных остатков (расщепляемые связи, образованные такой парой, или связь между такой парой и следующим в направлении к С-концу остатком) [627,632,18171- У трипсина наблюдается заметная предпочтительность к расщеплению связи Lys-Arg по сравнению со связью Arg-Lys [18181.
Следует отметить, что некоторые ферменты, обладающие специфичностью к основным остаткам в положении Р1, достаточно эффективно расщепляют связи, образованные другими остатками. Это особенно относится к цистеиновым проте-иназам папаину [1745,1802,1819,18201, калпаинам I и II [1821,18221 и др.
Предыдущая << 1 .. 80 81 82 83 84 85 < 86 > 87 88 89 90 91 92 .. 278 >> Следующая

Реклама

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed

Есть, чем поделиться? Отправьте
материал
нам
Авторские права © 2009 BooksShare.
Все права защищены.
Rambler's Top100

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed